مزايا تقنية خلايا وقود الهيدروجين هائلة لأنها لا تطلق أي انبعاثات على الإطلاق. يعتبر الهيدروجين حافزًا محتملًا للطاقة للمرافق وكذلك للنقل ، على الرغم من العديد من المشكلات التي تحول دون استخدام الهيدروجين كتطبيق عملي لتزويد النقل بالوقود:

قد يكون الهيدروجين مصدر الطاقة النظيفة في المستقبل.
-
خلايا وقود الهيدروجين هشة ، خاصة في درجات الحرارة الباردة ، مما يخلق مشكلة لاستخدام المركبات على الطرق الوعرة وفي المناخات الشمالية.
-
تعد خلايا وقود الهيدروجين تقنية أكثر تكلفة بكثير من محركات الاحتراق ، مما يحد من قدرتها على تحمل التكاليف لمجموعة واسعة من المستهلكين.
-
هناك حاجة إلى كمية أكبر من الهيدروجين للحصول على نفس الكمية من الطاقة مقارنة بالبنزين ، لذلك يحتاج الهيدروجين حاليًا إلى الضغط ، والذي بدوره يستهلك المزيد من الطاقة ، مما يقلل من إمكاناته الصديقة للبيئة.
-
يجب بناء محطات خاصة للتزود بالوقود في جميع أنحاء البلاد ، مما يزيد من تكلفة إدخال التكنولوجيا.
يعد استخدام خلايا وقود الهيدروجين في المركبات مجالًا للتطوير يستحق المشاهدة. يعمل الباحثون على التغلب على تحدياتها ، ومن الممكن أن تصل التكنولوجيا إلى النقطة التي يمكن فيها تنفيذ خلايا وقود الهيدروجين في المستقبل.